操縱氣相色譜儀如何選用不同氣體純度的氣源做載氣和輔助氣體，固然是一個老的技術題目，但是對于剛剛接觸氣相色譜儀的用戶，目前很難找到有關這方面的綜合資料，所以他們總是到處詢問究竟選擇什么樣的氣體純度的這類題目。根據每一家用戶具體使用的那一類（高，中，抵抗）儀器，選擇什么樣純度的氣體，確實是一個比較復雜的題目。
       原則上講，選擇氣體純度時，主要取決于① 分析對象；②色譜柱中填充物；③檢測器。我們建議在滿足分析要求的條件下，盡可能選用純度較高的氣體。這樣不但會進步（保持）儀器的高靈敏度，而且會延長色譜柱，整臺儀器（氣路控制部件，氣體過濾器）的壽命。實踐證實，作為中儀器，長期使用較低純度的氣體氣源，一旦要求分析低濃度的樣品時，要想恢復儀器的高靈敏度有時十分困難。對于低檔儀器，作常量或半微量分析，選用高純度的氣體，不但增加了運行本錢，有時還增加了氣路的復雜性，更輕易出現漏氣或其他的題目而影響儀器的正常操縱。另外，為了某些特殊的分析目的要求特地在載氣中加進某些“不純物”，如：分析極性化合物添加適量的水蒸氣，操縱火焰光度檢測器時，為了進步分析硫化物的靈敏度，而添加微量硫。操縱氦離子化檢測器要氖的含量必須在5~25ppm，否則會在分析氫，氮和氬氣時產生負峰或“W”形峰等。
        一． 氣體純度低的不良影響
根據分析對象，色譜柱的類型，操縱儀器的擋次和具體檢測器，若使用分歧要求的低純度氣體，不良影響有以下幾種可能：
1）樣品失真或消失：如H2O氣使**硅樣品水解；
2）色譜柱失效：H2O，CO2使分子篩柱失往活性，H2O氣使聚脂類固定液分解，O2使PEG斷鏈。
3）對柱保存特性的影響：如：H2O對聚乙二醇等親水性固定液的保存指數會有所增加，載氣中氧含量過高時，無論是極性或是非極性固定液柱的保存特性，都會產生變化，使用時間越長影響越大。